IBM服务器用户使用说明

IBM 服务器用户使用说明 1. 集群介绍 整套集群由四部分组成： Power 720 管理登录节点 +5 台 Power 755 计算节点 (128 进程 / 台 )+10 台 Intel Xeon 系列计算节点 (24 进程 / 台 )+DS5020 存储系统。 2. 作业管理 Power 755 计算节点是 IA64 结构， Intel Xeon 计算节点是 X86_64 结构。整 套集群安装了两套作业管理软件： IBM LoadLeveler 和 PBS(Torque) 。 LoadLeveler 用来管理 Power 755 计算节点上的作业， Torque 用来管理 Intel Xeon 系列计算节 点上的作业。 2.1 LoadLeveler 在 Power 755 这些节点上可以运行的软件有： Gaussian ， Gamess ， molcas 和 molpro. 2.1.1 Gaussian 版本 Gaussian 09, Revision B.01 1. 编写作业卡，文件名 jobname.com ( 文件后缀一定为 com) 2. 提交命令： $q09 NPP jobname (NPP 代表并行进程数， jobname 为作业文件名，不需后缀 ) 例如： $q09 16 au2 ( 它将为作业 au2.com 分配 16 个并行进程， 作业结束后生成结果文件 au2.out) 3. 如不记得输入参数， 可提交命令 $q09, 它会出现 Usage: q09 NPP jobname! 4. 由于计算结点上最大为 128 进程，并且 Gaussian 并行效率不高，因此希 望在试运行期间提交作业 NPP 设为 8, 16, 32, 64 为好。 5. Gaussian 的临时区设在 /gpfs/scratch 中 , 该区文件随时可能清空。 2.1.2 Gamess 版本 GAMESS VERSION = 1 OCT 2010 (R3) 1. 编写作业卡，文件名 jobname.inp ( 文件后缀一定为 inp) 2. 提交命令： $qgms NPP jobname (NPP 代表并行进程数， jobname 为作业文件名，不需后缀 ) 例如： $qgms 16 au2 ( 它将为作业 au2.inp 分配 16 个并行进程，